חומרים משמרים אנטי-מיקרוביאליים ישימים במגוון רחב של תעשיות. במגזר הכימיקלים היומיומי, הם מנוצלים במוצרים כגון שמפו, שטיפת גוף ופריטי טיפוח. מאחר שצורכי היומיום הללו עשירים בלחות וחומרי הזנה-מה שהופך אותם לקרקע פורייה להתרבות מיקרוביאלית-חומרים משמרים אנטי-מיקרוביאליים מעכבים ביעילות את הצמיחה של חיידקים, פטריות ומיקרואורגניזמים אחרים, ובכך מונעים קלקול של המוצר ומבטיחים גם בטיחות וגם יעילות.
למשל, שילוב חומרים משמרים אנטי-מיקרוביאליים במוצרי טיפוח העור מונע זיהום מיקרוביאלי במהלך השימוש ומאריך את חיי המדף שלהם.
בתעשיית המזון משתמשים בחומרים משמרים אנטי-מיקרוביאליים לשימור והגנה על מוצרי מזון שונים. עבור משקאות-כגון משקאות מוגזים ומיצי פירות-הוספת כמות מתאימה של חומר משמר מעכבת את גדילת החיידקים, ובכך שומרת על טעמו ואיכותו של המשקה. במוצרי בשר, השימוש בחומרים משמרים אנטי-מיקרוביאליים מדכא את הצמיחה של מיקרואורגניזמים מזיקים-כגון *Clostridium botulinum*-ומאריך את חיי המדף של הבשר. במוצרי מאפה, כמו מאפים ולחם, חומרים משמרים אלו מונעים התפשטות של עובש וחיידקים, ובכך שומרים על טריות המזון.
במגזר התעשייתי, ציפויים וצבעים על בסיס מים-רגישים לזיהום מיקרוביאלי במהלך האחסון והיישום; הוספת חומרים משמרים אנטי-מיקרוביאליים מעכבת צמיחה של חיידקים ומבטיחה יציבות באיכות המוצר. דבקים גם עומדים בפני סיכונים של זיהום מיקרוביאלי במהלך הייצור, האחסון והיישום; חומרים משמרים אלו מונעים התפשטות חיידקים ומשפרים את ביצועי הדבק. בתעשיית ייצור הנייר, תהליכי ייצור של עיסת נייר מועדים לפירוק חיידקי; הוספת חומרים משמרים לעיסה מעכבת צמיחה של חיידקים, ובכך משפרת את איכות הנייר ויעילות הייצור.
בתעשיית ההדפסה והצביעה של טקסטיל, אמבטיות צבע וחומרי עזר לעיבוד מועדים לגידול מיקרוביאלי, מה שעלול לפגוע בתוצאות ההדפסה ובאיכות הבד; חומרים משמרים אנטי-מיקרוביאליים מבטיחים ביצוע חלק של תהליך הצביעה ואת שלמות הבד. בתחום הטיפול במים, חומרים משמרים אלו מנוצלים במערכות כגון מחזורי מי קירור ומתקני טיפול בשפכים לבלימת התפשטות חיידקים במים, מניעת קורוזיה וסתימת צנרת וציוד והבטחת פעילות תקינה של המערכת כולה.
